Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLFN5Q08AF3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLFN5Q08AF3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms