Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRTAP1-1Q07627 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRTAP1-1Q07627 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KRTAP1-1Q07627 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KRTAP1-1Q07627 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRTAP1-1Q07627 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRTAP1-1Q07627 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KRTAP1-1Q07627 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KRTAP1-1Q07627 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms