Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CKAP4Q07065 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CKAP4Q07065 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms