Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIN1Q05586 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GRIN1Q05586 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms