Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EXOSC10Q01780 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms