Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
IFITM3Q01628 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
IFITM3Q01628 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms