Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
IRF9Q00978 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IRF9Q00978 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms