Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDLBPQ00341 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDLBPQ00341 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms