Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATP2C1P98194 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP2C1P98194 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms