Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HTRA4P83105 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HTRA4P83105 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms