Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IRX6P78412 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IRX6P78412 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IRX6P78412 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IRX6P78412 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IRX6P78412 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IRX6P78412 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IRX6P78412 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IRX6P78412 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IRX6P78412 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IRX6P78412 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IRX6P78412 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IRX6P78412 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IRX6P78412 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IRX6P78412 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
IRX6P78412 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IRX6P78412 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IRX6P78412 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IRX6P78412 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IRX6P78412 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IRX6P78412 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IRX6P78412 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IRX6P78412 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IRX6P78412 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IRX6P78412 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IRX6P78412 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IRX6P78412 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IRX6P78412 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IRX6P78412 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IRX6P78412 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IRX6P78412 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IRX6P78412 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IRX6P78412 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IRX6P78412 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IRX6P78412 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IRX6P78412 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IRX6P78412 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IRX6P78412 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IRX6P78412 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IRX6P78412 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
IRX6P78412 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IRX6P78412 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
IRX6P78412 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
IRX6P78412 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
IRX6P78412 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
IRX6P78412 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
IRX6P78412 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IRX6P78412 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IRX6P78412 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IRX6P78412 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IRX6P78412 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
IRX6P78412 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IRX6P78412 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRX6P78412 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRX6P78412 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRX6P78412 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRX6P78412 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRX6P78412 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRX6P78412 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRX6P78412 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRX6P78412 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRX6P78412 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRX6P78412 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRX6P78412 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
IRX6P78412 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRX6P78412 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRX6P78412 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRX6P78412 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRX6P78412 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRX6P78412 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRX6P78412 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRX6P78412 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRX6P78412 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRX6P78412 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRX6P78412 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRX6P78412 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRX6P78412 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IRX6P78412 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IRX6P78412 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IRX6P78412 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IRX6P78412 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IRX6P78412 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IRX6P78412 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
IRX6P78412 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IRX6P78412 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IRX6P78412 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IRX6P78412 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IRX6P78412 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IRX6P78412 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IRX6P78412 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IRX6P78412 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
IRX6P78412 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IRX6P78412 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IRX6P78412 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IRX6P78412 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IRX6P78412 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IRX6P78412 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IRX6P78412 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IRX6P78412 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IRX6P78412 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms