Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRAMEP78395 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRAMEP78395 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRAMEP78395 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRAMEP78395 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRAMEP78395 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRAMEP78395 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRAMEP78395 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRAMEP78395 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRAMEP78395 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRAMEP78395 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms