Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ASIC1P78348 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASIC1P78348 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms