Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC5P78333 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC5P78333 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC5P78333 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC5P78333 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC5P78333 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC5P78333 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC5P78333 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC5P78333 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC5P78333 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC5P78333 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPC5P78333 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC5P78333 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC5P78333 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC5P78333 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC5P78333 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC5P78333 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC5P78333 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC5P78333 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC5P78333 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC5P78333 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC5P78333 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC5P78333 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC5P78333 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC5P78333 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC5P78333 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC5P78333 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPC5P78333 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GPC5P78333 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC5P78333 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC5P78333 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC5P78333 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC5P78333 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC5P78333 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC5P78333 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC5P78333 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC5P78333 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC5P78333 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC5P78333 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC5P78333 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC5P78333 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC5P78333 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPC5P78333 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC5P78333 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC5P78333 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC5P78333 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC5P78333 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC5P78333 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPC5P78333 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC5P78333 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC5P78333 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC5P78333 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC5P78333 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC5P78333 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC5P78333 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC5P78333 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC5P78333 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC5P78333 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC5P78333 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC5P78333 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC5P78333 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC5P78333 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC5P78333 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC5P78333 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC5P78333 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC5P78333 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC5P78333 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC5P78333 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPC5P78333 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC5P78333 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC5P78333 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC5P78333 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC5P78333 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC5P78333 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC5P78333 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC5P78333 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC5P78333 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPC5P78333 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC5P78333 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC5P78333 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC5P78333 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC5P78333 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC5P78333 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC5P78333 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC5P78333 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPC5P78333 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC5P78333 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC5P78333 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC5P78333 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC5P78333 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC5P78333 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC5P78333 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC5P78333 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC5P78333 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC5P78333 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC5P78333 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC5P78333 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC5P78333 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC5P78333 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPC5P78333 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms