Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
HERVK_113P62684 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HERVK_113P62684 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms