Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMC1P62191 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSMC1P62191 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMC1P62191 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMC1P62191 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms