Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFM1P61960 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFM1P61960 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFM1P61960 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFM1P61960 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFM1P61960 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFM1P61960 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFM1P61960 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFM1P61960 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFM1P61960 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFM1P61960 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFM1P61960 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFM1P61960 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFM1P61960 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFM1P61960 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFM1P61960 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFM1P61960 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFM1P61960 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFM1P61960 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
UFM1P61960 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFM1P61960 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFM1P61960 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFM1P61960 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFM1P61960 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFM1P61960 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFM1P61960 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFM1P61960 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFM1P61960 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFM1P61960 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFM1P61960 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFM1P61960 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFM1P61960 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFM1P61960 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFM1P61960 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFM1P61960 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFM1P61960 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFM1P61960 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFM1P61960 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFM1P61960 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFM1P61960 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFM1P61960 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFM1P61960 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFM1P61960 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFM1P61960 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFM1P61960 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFM1P61960 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFM1P61960 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFM1P61960 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFM1P61960 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFM1P61960 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFM1P61960 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFM1P61960 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFM1P61960 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
UFM1P61960 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFM1P61960 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFM1P61960 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFM1P61960 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFM1P61960 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFM1P61960 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFM1P61960 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFM1P61960 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFM1P61960 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFM1P61960 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFM1P61960 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFM1P61960 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UFM1P61960 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UFM1P61960 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UFM1P61960 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UFM1P61960 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UFM1P61960 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UFM1P61960 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UFM1P61960 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UFM1P61960 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UFM1P61960 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UFM1P61960 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UFM1P61960 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UFM1P61960 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UFM1P61960 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UFM1P61960 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UFM1P61960 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UFM1P61960 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UFM1P61960 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UFM1P61960 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UFM1P61960 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UFM1P61960 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UFM1P61960 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
UFM1P61960 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UFM1P61960 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UFM1P61960 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UFM1P61960 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UFM1P61960 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UFM1P61960 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UFM1P61960 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UFM1P61960 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UFM1P61960 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UFM1P61960 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UFM1P61960 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UFM1P61960 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UFM1P61960 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UFM1P61960 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms