Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
POLR2FP61218 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2FP61218 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms