Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNAP25P60880 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNAP25P60880 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms