Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms