Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX16P57768 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX16P57768 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX16P57768 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX16P57768 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX16P57768 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX16P57768 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX16P57768 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX16P57768 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX16P57768 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX16P57768 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX16P57768 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX16P57768 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX16P57768 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX16P57768 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX16P57768 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX16P57768 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX16P57768 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX16P57768 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX16P57768 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX16P57768 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX16P57768 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX16P57768 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX16P57768 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX16P57768 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX16P57768 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX16P57768 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX16P57768 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX16P57768 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX16P57768 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX16P57768 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX16P57768 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX16P57768 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX16P57768 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX16P57768 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX16P57768 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX16P57768 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX16P57768 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX16P57768 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX16P57768 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX16P57768 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX16P57768 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX16P57768 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX16P57768 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX16P57768 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX16P57768 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX16P57768 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX16P57768 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX16P57768 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX16P57768 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX16P57768 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX16P57768 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX16P57768 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX16P57768 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX16P57768 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX16P57768 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX16P57768 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX16P57768 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX16P57768 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX16P57768 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX16P57768 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX16P57768 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX16P57768 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX16P57768 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX16P57768 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX16P57768 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX16P57768 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX16P57768 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX16P57768 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX16P57768 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX16P57768 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX16P57768 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX16P57768 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX16P57768 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX16P57768 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX16P57768 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX16P57768 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX16P57768 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX16P57768 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX16P57768 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX16P57768 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX16P57768 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX16P57768 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX16P57768 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX16P57768 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX16P57768 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX16P57768 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX16P57768 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX16P57768 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX16P57768 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX16P57768 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX16P57768 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX16P57768 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX16P57768 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX16P57768 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX16P57768 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX16P57768 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX16P57768 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX16P57768 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX16P57768 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms