Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCBP4P57723 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCBP4P57723 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms