Protein–RNA interactions for Protein: P57087

JAM2, Junctional adhesion molecule B, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAM2P57087 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
JAM2P57087 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
JAM2P57087 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
JAM2P57087 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
JAM2P57087 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
JAM2P57087 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
JAM2P57087 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
JAM2P57087 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
JAM2P57087 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
JAM2P57087 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
JAM2P57087 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
JAM2P57087 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
JAM2P57087 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
JAM2P57087 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
JAM2P57087 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
JAM2P57087 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
JAM2P57087 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
JAM2P57087 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
JAM2P57087 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
JAM2P57087 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
JAM2P57087 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
JAM2P57087 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
JAM2P57087 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
JAM2P57087 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
JAM2P57087 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
JAM2P57087 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
JAM2P57087 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
JAM2P57087 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
JAM2P57087 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
JAM2P57087 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
JAM2P57087 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
JAM2P57087 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
JAM2P57087 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
JAM2P57087 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
JAM2P57087 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
JAM2P57087 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
JAM2P57087 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
JAM2P57087 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
JAM2P57087 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
JAM2P57087 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
JAM2P57087 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
JAM2P57087 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
JAM2P57087 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
JAM2P57087 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
JAM2P57087 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
JAM2P57087 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
JAM2P57087 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
JAM2P57087 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
JAM2P57087 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
JAM2P57087 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
JAM2P57087 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
JAM2P57087 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
JAM2P57087 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
JAM2P57087 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
JAM2P57087 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
JAM2P57087 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
JAM2P57087 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
JAM2P57087 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
JAM2P57087 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
JAM2P57087 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
JAM2P57087 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
JAM2P57087 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
JAM2P57087 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
JAM2P57087 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
JAM2P57087 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
JAM2P57087 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
JAM2P57087 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
JAM2P57087 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
JAM2P57087 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
JAM2P57087 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
JAM2P57087 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
JAM2P57087 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
JAM2P57087 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
JAM2P57087 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
JAM2P57087 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
JAM2P57087 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
JAM2P57087 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
JAM2P57087 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
JAM2P57087 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
JAM2P57087 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
JAM2P57087 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
JAM2P57087 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
JAM2P57087 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
JAM2P57087 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
JAM2P57087 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
JAM2P57087 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
JAM2P57087 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
JAM2P57087 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
JAM2P57087 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
JAM2P57087 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
JAM2P57087 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
JAM2P57087 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
JAM2P57087 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
JAM2P57087 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
JAM2P57087 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
JAM2P57087 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
JAM2P57087 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
JAM2P57087 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
JAM2P57087 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
JAM2P57087 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms