Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLTPP55058 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLTPP55058 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLTPP55058 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLTPP55058 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLTPP55058 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLTPP55058 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLTPP55058 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLTPP55058 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLTPP55058 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLTPP55058 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PLTPP55058 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLTPP55058 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLTPP55058 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLTPP55058 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PLTPP55058 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PLTPP55058 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PLTPP55058 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLTPP55058 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLTPP55058 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLTPP55058 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLTPP55058 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLTPP55058 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PLTPP55058 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLTPP55058 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLTPP55058 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLTPP55058 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLTPP55058 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLTPP55058 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLTPP55058 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLTPP55058 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLTPP55058 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PLTPP55058 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PLTPP55058 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLTPP55058 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLTPP55058 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLTPP55058 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLTPP55058 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLTPP55058 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PLTPP55058 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLTPP55058 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLTPP55058 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLTPP55058 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLTPP55058 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLTPP55058 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLTPP55058 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLTPP55058 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PLTPP55058 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLTPP55058 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLTPP55058 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLTPP55058 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLTPP55058 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLTPP55058 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLTPP55058 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLTPP55058 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLTPP55058 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLTPP55058 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLTPP55058 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLTPP55058 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLTPP55058 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLTPP55058 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLTPP55058 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLTPP55058 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLTPP55058 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLTPP55058 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLTPP55058 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLTPP55058 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLTPP55058 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLTPP55058 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLTPP55058 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLTPP55058 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLTPP55058 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLTPP55058 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLTPP55058 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLTPP55058 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLTPP55058 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLTPP55058 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLTPP55058 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLTPP55058 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLTPP55058 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLTPP55058 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLTPP55058 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLTPP55058 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLTPP55058 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLTPP55058 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PLTPP55058 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLTPP55058 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLTPP55058 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PLTPP55058 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLTPP55058 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLTPP55058 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLTPP55058 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PLTPP55058 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLTPP55058 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLTPP55058 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLTPP55058 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLTPP55058 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLTPP55058 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLTPP55058 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLTPP55058 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms