Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAD23BP54727 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAD23BP54727 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms