Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YARSP54577 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
YARSP54577 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YARSP54577 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YARSP54577 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
YARSP54577 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YARSP54577 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
YARSP54577 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YARSP54577 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YARSP54577 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
YARSP54577 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YARSP54577 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YARSP54577 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
YARSP54577 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YARSP54577 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YARSP54577 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YARSP54577 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YARSP54577 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YARSP54577 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YARSP54577 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YARSP54577 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YARSP54577 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YARSP54577 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
YARSP54577 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
YARSP54577 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
YARSP54577 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
YARSP54577 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
YARSP54577 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
YARSP54577 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YARSP54577 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YARSP54577 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YARSP54577 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YARSP54577 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YARSP54577 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
YARSP54577 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YARSP54577 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
YARSP54577 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YARSP54577 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
YARSP54577 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YARSP54577 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YARSP54577 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
YARSP54577 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YARSP54577 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YARSP54577 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YARSP54577 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YARSP54577 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
YARSP54577 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YARSP54577 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YARSP54577 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
YARSP54577 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YARSP54577 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YARSP54577 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YARSP54577 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
YARSP54577 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
YARSP54577 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YARSP54577 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YARSP54577 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YARSP54577 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YARSP54577 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YARSP54577 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YARSP54577 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YARSP54577 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YARSP54577 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YARSP54577 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YARSP54577 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YARSP54577 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
YARSP54577 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YARSP54577 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YARSP54577 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YARSP54577 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
YARSP54577 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YARSP54577 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YARSP54577 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
YARSP54577 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YARSP54577 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YARSP54577 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YARSP54577 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YARSP54577 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
YARSP54577 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YARSP54577 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
YARSP54577 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YARSP54577 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YARSP54577 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YARSP54577 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
YARSP54577 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YARSP54577 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YARSP54577 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YARSP54577 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
YARSP54577 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YARSP54577 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YARSP54577 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YARSP54577 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YARSP54577 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YARSP54577 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YARSP54577 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
YARSP54577 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
YARSP54577 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
YARSP54577 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YARSP54577 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
YARSP54577 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms