Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRISP1P54107 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRISP1P54107 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRISP1P54107 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRISP1P54107 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRISP1P54107 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRISP1P54107 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CRISP1P54107 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CRISP1P54107 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CRISP1P54107 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CRISP1P54107 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CRISP1P54107 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms