Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP3M2P53677 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP3M2P53677 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms