Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC3P51654 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC3P51654 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC3P51654 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC3P51654 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC3P51654 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC3P51654 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC3P51654 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC3P51654 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC3P51654 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC3P51654 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC3P51654 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC3P51654 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC3P51654 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC3P51654 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC3P51654 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC3P51654 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC3P51654 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC3P51654 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC3P51654 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC3P51654 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC3P51654 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC3P51654 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC3P51654 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC3P51654 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC3P51654 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC3P51654 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC3P51654 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC3P51654 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC3P51654 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC3P51654 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC3P51654 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC3P51654 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC3P51654 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC3P51654 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC3P51654 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC3P51654 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC3P51654 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC3P51654 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC3P51654 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC3P51654 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC3P51654 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC3P51654 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC3P51654 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC3P51654 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC3P51654 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC3P51654 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC3P51654 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC3P51654 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC3P51654 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC3P51654 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC3P51654 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC3P51654 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC3P51654 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC3P51654 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC3P51654 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC3P51654 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC3P51654 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC3P51654 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC3P51654 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC3P51654 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC3P51654 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC3P51654 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC3P51654 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC3P51654 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC3P51654 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC3P51654 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC3P51654 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC3P51654 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC3P51654 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC3P51654 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC3P51654 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC3P51654 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC3P51654 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC3P51654 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC3P51654 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC3P51654 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC3P51654 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC3P51654 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC3P51654 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC3P51654 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC3P51654 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC3P51654 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC3P51654 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC3P51654 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC3P51654 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC3P51654 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC3P51654 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC3P51654 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC3P51654 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC3P51654 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC3P51654 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC3P51654 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC3P51654 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC3P51654 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC3P51654 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC3P51654 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC3P51654 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC3P51654 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC3P51654 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms