Protein–RNA interactions for Protein: P51164

ATP4B, Potassium-transporting ATPase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4BP51164 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4BP51164 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP4BP51164 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms