Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BRCC3P46736 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRCC3P46736 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms