Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MMP13P45452 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MMP13P45452 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MMP13P45452 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MMP13P45452 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MMP13P45452 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MMP13P45452 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MMP13P45452 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MMP13P45452 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MMP13P45452 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MMP13P45452 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MMP13P45452 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MMP13P45452 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MMP13P45452 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MMP13P45452 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP13P45452 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP13P45452 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP13P45452 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP13P45452 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP13P45452 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP13P45452 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP13P45452 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP13P45452 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP13P45452 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP13P45452 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP13P45452 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP13P45452 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP13P45452 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP13P45452 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP13P45452 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP13P45452 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP13P45452 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP13P45452 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP13P45452 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP13P45452 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP13P45452 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP13P45452 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP13P45452 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP13P45452 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP13P45452 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP13P45452 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP13P45452 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP13P45452 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP13P45452 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP13P45452 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP13P45452 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP13P45452 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP13P45452 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP13P45452 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP13P45452 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP13P45452 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP13P45452 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP13P45452 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP13P45452 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP13P45452 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP13P45452 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP13P45452 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MMP13P45452 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP13P45452 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP13P45452 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP13P45452 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP13P45452 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP13P45452 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP13P45452 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP13P45452 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP13P45452 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP13P45452 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP13P45452 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP13P45452 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP13P45452 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP13P45452 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP13P45452 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP13P45452 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP13P45452 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP13P45452 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP13P45452 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MMP13P45452 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP13P45452 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP13P45452 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP13P45452 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP13P45452 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP13P45452 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP13P45452 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP13P45452 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MMP13P45452 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MMP13P45452 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MMP13P45452 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP13P45452 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP13P45452 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP13P45452 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP13P45452 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP13P45452 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP13P45452 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP13P45452 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP13P45452 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP13P45452 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP13P45452 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP13P45452 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MMP13P45452 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MMP13P45452 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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