Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTGER3P43115 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms