Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC1A4P43007 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC1A4P43007 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms