Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
NCAPD3P42695 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NCAPD3P42695 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
NCAPD3P42695 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
NCAPD3P42695 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
NCAPD3P42695 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
NCAPD3P42695 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
NCAPD3P42695 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
NCAPD3P42695 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NCAPD3P42695 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
NCAPD3P42695 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
NCAPD3P42695 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
NCAPD3P42695 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NCAPD3P42695 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
NCAPD3P42695 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
NCAPD3P42695 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
NCAPD3P42695 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
NCAPD3P42695 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
NCAPD3P42695 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
NCAPD3P42695 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
NCAPD3P42695 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
NCAPD3P42695 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC37.71■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC37.7■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
NCAPD3P42695 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
NCAPD3P42695 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
NCAPD3P42695 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
NCAPD3P42695 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
NCAPD3P42695 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
NCAPD3P42695 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NCAPD3P42695 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NCAPD3P42695 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NCAPD3P42695 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NCAPD3P42695 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NCAPD3P42695 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NCAPD3P42695 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
NCAPD3P42695 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
NCAPD3P42695 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
NCAPD3P42695 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
NCAPD3P42695 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
NCAPD3P42695 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
NCAPD3P42695 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
NCAPD3P42695 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
NCAPD3P42695 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NCAPD3P42695 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NCAPD3P42695 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms