Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOBEC1P41238 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOBEC1P41238 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms