Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP8P40818 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP8P40818 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP8P40818 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP8P40818 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP8P40818 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP8P40818 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP8P40818 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP8P40818 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP8P40818 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP8P40818 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP8P40818 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP8P40818 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP8P40818 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP8P40818 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP8P40818 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP8P40818 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP8P40818 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP8P40818 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP8P40818 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP8P40818 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP8P40818 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP8P40818 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP8P40818 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP8P40818 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP8P40818 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
USP8P40818 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP8P40818 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP8P40818 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP8P40818 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP8P40818 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP8P40818 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP8P40818 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP8P40818 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP8P40818 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP8P40818 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP8P40818 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP8P40818 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP8P40818 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP8P40818 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP8P40818 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP8P40818 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP8P40818 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP8P40818 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP8P40818 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP8P40818 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP8P40818 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP8P40818 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP8P40818 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP8P40818 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP8P40818 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP8P40818 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP8P40818 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP8P40818 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP8P40818 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP8P40818 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP8P40818 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP8P40818 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP8P40818 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP8P40818 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP8P40818 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP8P40818 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP8P40818 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP8P40818 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP8P40818 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP8P40818 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP8P40818 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP8P40818 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP8P40818 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP8P40818 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP8P40818 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP8P40818 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP8P40818 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP8P40818 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP8P40818 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP8P40818 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP8P40818 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP8P40818 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP8P40818 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP8P40818 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP8P40818 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP8P40818 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP8P40818 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP8P40818 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP8P40818 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP8P40818 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP8P40818 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP8P40818 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP8P40818 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP8P40818 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP8P40818 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP8P40818 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP8P40818 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP8P40818 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP8P40818 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP8P40818 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP8P40818 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP8P40818 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP8P40818 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP8P40818 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms