Protein–RNA interactions for Protein: P37020

GEF1, Anion/proton exchange transporter GEF1, yeastyeast

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GEF1P37020 MTM1YGR257C 1101 nt5.12□□□□□ -1.59
GEF1P37020 AGE2YIL044C 897 nt5.12□□□□□ -1.59
GEF1P37020 LSO1YJR005C-A 282 nt5.12□□□□□ -1.59
GEF1P37020 NKP2YLR315W 462 nt5.12□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YNL089CYNL089C 477 nt5.12□□□□□ -1.59
GEF1P37020 AVT5YBL089W 1380 nt5.12□□□□□ -1.59
GEF1P37020 GWT1YJL091C 1473 nt5.12□□□□□ -1.59
GEF1P37020 TDA1YMR291W 1761 nt5.11□□□□□ -1.59
GEF1P37020 HNT1YDL125C 477 nt5.11□□□□□ -1.59
GEF1P37020 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt5.11□□□□□ -1.59
GEF1P37020 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt5.11□□□□□ -1.59
GEF1P37020 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt5.11□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YIR020CYIR020C 303 nt5.11□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YLR224WYLR224W 1110 nt5.11□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt5.11□□□□□ -1.59
GEF1P37020 RPS16AYMR143W 432 nt5.11□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YOL114CYOL114C 609 nt5.11□□□□□ -1.59
GEF1P37020 SVS1YPL163C 783 nt5.11□□□□□ -1.59
GEF1P37020 DER1YBR201W 636 nt5.11□□□□□ -1.59
GEF1P37020 LYP1YNL268W 1836 nt5.11□□□□□ -1.59
GEF1P37020 CAF4YKR036C 1932 nt5.11□□□□□ -1.59
GEF1P37020 BEM4YPL161C 1902 nt5.11□□□□□ -1.59
GEF1P37020 VID27YNL212W 2349 nt5.11□□□□□ -1.59
GEF1P37020 CRT10YOL063C 2874 nt5.1□□□□□ -1.59
GEF1P37020 HMG1YML075C 3165 nt5.1□□□□□ -1.59
GEF1P37020 MIC19YFR011C 513 nt5.1□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YJL086CYJL086C 369 nt5.1□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt5.1□□□□□ -1.59
GEF1P37020 AFB1YLR040C 675 nt5.1□□□□□ -1.59
GEF1P37020 FAR8YMR029C 1572 nt5.1□□□□□ -1.59
GEF1P37020 RIM9YMR063W 720 nt5.1□□□□□ -1.59
GEF1P37020 NCS2YNL119W 1482 nt5.1□□□□□ -1.59
GEF1P37020 TOM22YNL131W 459 nt5.1□□□□□ -1.59
GEF1P37020 LDS2YOL047C 1071 nt5.1□□□□□ -1.59
GEF1P37020 snR17asnR17a 333 nt5.1□□□□□ -1.59
GEF1P37020 CBP3YPL215W 1008 nt5.1□□□□□ -1.59
GEF1P37020 NRP1YDL167C 2160 nt5.09□□□□□ -1.59
GEF1P37020 STI1YOR027W 1770 nt5.09□□□□□ -1.59
GEF1P37020 DIT2YDR402C 1470 nt5.09□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YER187WYER187W 426 nt5.09□□□□□ -1.59
GEF1P37020 RPL11BYGR085C 525 nt5.09□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt5.09□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YAL004WYAL004W 648 nt5.09□□□□□ -1.59
GEF1P37020 YJR111CYJR111C 852 nt5.09□□□□□ -1.59
GEF1P37020 FMP46YKR049C 402 nt5.09□□□□□ -1.59
GEF1P37020 SDO1YLR022C 753 nt5.09□□□□□ -1.59
GEF1P37020 RPL16BYNL069C 597 nt5.09□□□□□ -1.59
GEF1P37020 RPL11AYPR102C 525 nt5.09□□□□□ -1.59
GEF1P37020 GCR1YPL075W 2358 nt5.08□□□□□ -1.6
GEF1P37020 FMN1YDR236C 657 nt5.08□□□□□ -1.6
GEF1P37020 MRPL3YMR024W 1173 nt5.08□□□□□ -1.6
GEF1P37020 GPI15YNL038W 690 nt5.08□□□□□ -1.6
GEF1P37020 ATG3YNR007C 933 nt5.08□□□□□ -1.6
GEF1P37020 PHM7YOL084W 2976 nt5.08□□□□□ -1.6
GEF1P37020 YER158CYER158C 1722 nt5.08□□□□□ -1.6
GEF1P37020 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt5.08□□□□□ -1.6
GEF1P37020 EXO5YBR163W 1758 nt5.07□□□□□ -1.6
GEF1P37020 YCR064CYCR064C 411 nt5.07□□□□□ -1.6
GEF1P37020 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt5.07□□□□□ -1.6
GEF1P37020 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt5.07□□□□□ -1.6
GEF1P37020 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt5.07□□□□□ -1.6
GEF1P37020 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt5.07□□□□□ -1.6
GEF1P37020 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt5.07□□□□□ -1.6
GEF1P37020 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt5.07□□□□□ -1.6
GEF1P37020 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt5.07□□□□□ -1.6
GEF1P37020 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt5.07□□□□□ -1.6
GEF1P37020 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt5.07□□□□□ -1.6
GEF1P37020 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt5.07□□□□□ -1.6
GEF1P37020 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt5.07□□□□□ -1.6
GEF1P37020 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt5.07□□□□□ -1.6
GEF1P37020 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt5.07□□□□□ -1.6
GEF1P37020 SPT2YER161C 1002 nt5.07□□□□□ -1.6
GEF1P37020 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt5.07□□□□□ -1.6
GEF1P37020 CNB1YKL190W 528 nt5.07□□□□□ -1.6
GEF1P37020 CMS1YLR003C 876 nt5.07□□□□□ -1.6
GEF1P37020 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt5.07□□□□□ -1.6
GEF1P37020 RHO5YNL180C 996 nt5.07□□□□□ -1.6
GEF1P37020 YPL077CYPL077C 723 nt5.07□□□□□ -1.6
GEF1P37020 MNT2YGL257C 1677 nt5.07□□□□□ -1.6
GEF1P37020 MPS3YJL019W 2049 nt5.07□□□□□ -1.6
GEF1P37020 YKL050CYKL050C 2769 nt5.06□□□□□ -1.6
GEF1P37020 POL4YCR014C 1749 nt5.06□□□□□ -1.6
GEF1P37020 ARF1YDL192W 546 nt5.06□□□□□ -1.6
GEF1P37020 IES5YER092W 378 nt5.06□□□□□ -1.6
GEF1P37020 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt5.06□□□□□ -1.6
GEF1P37020 YLR177WYLR177W 1887 nt5.05□□□□□ -1.6
GEF1P37020 TRX3YCR083W 384 nt5.05□□□□□ -1.6
GEF1P37020 snR7-SsnR7-S 179 nt5.05□□□□□ -1.6
GEF1P37020 ECL1YGR146C 636 nt5.05□□□□□ -1.6
GEF1P37020 YAP3YHL009C 993 nt5.05□□□□□ -1.6
GEF1P37020 RPI1YIL119C 1224 nt5.05□□□□□ -1.6
GEF1P37020 YKL044WYKL044W 321 nt5.05□□□□□ -1.6
GEF1P37020 snR41snR41 95 nt5.05□□□□□ -1.6
GEF1P37020 SMI1YGR229C 1518 nt5.05□□□□□ -1.6
GEF1P37020 TIF4632YGL049C 2745 nt5.05□□□□□ -1.6
GEF1P37020 PGM2YMR105C 1710 nt5.05□□□□□ -1.6
GEF1P37020 HOT1YMR172W 2160 nt5.05□□□□□ -1.6
GEF1P37020 SRP68YPL243W 1800 nt5.04□□□□□ -1.6
GEF1P37020 YJL132WYJL132W 2253 nt5.04□□□□□ -1.6
GEF1P37020 YMR221CYMR221C 1515 nt5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.8 ms