Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP5C1P36542 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP5C1P36542 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms