Protein–RNA interactions for Protein: P35968

KDR, Vascular endothelial growth factor receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDRP35968 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDRP35968 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDRP35968 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDRP35968 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDRP35968 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KDRP35968 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
KDRP35968 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDRP35968 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDRP35968 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDRP35968 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDRP35968 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDRP35968 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDRP35968 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
KDRP35968 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDRP35968 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDRP35968 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDRP35968 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDRP35968 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDRP35968 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KDRP35968 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDRP35968 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDRP35968 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDRP35968 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KDRP35968 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDRP35968 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDRP35968 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDRP35968 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDRP35968 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDRP35968 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDRP35968 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDRP35968 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KDRP35968 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDRP35968 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDRP35968 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDRP35968 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDRP35968 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDRP35968 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDRP35968 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDRP35968 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
KDRP35968 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDRP35968 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDRP35968 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDRP35968 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDRP35968 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDRP35968 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
KDRP35968 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDRP35968 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDRP35968 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDRP35968 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDRP35968 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDRP35968 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDRP35968 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDRP35968 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDRP35968 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDRP35968 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDRP35968 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDRP35968 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDRP35968 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDRP35968 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDRP35968 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDRP35968 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDRP35968 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
KDRP35968 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
KDRP35968 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDRP35968 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDRP35968 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDRP35968 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDRP35968 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDRP35968 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDRP35968 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KDRP35968 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDRP35968 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDRP35968 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDRP35968 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDRP35968 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDRP35968 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
KDRP35968 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDRP35968 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDRP35968 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDRP35968 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDRP35968 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDRP35968 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDRP35968 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDRP35968 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDRP35968 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDRP35968 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDRP35968 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDRP35968 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDRP35968 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDRP35968 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDRP35968 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDRP35968 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDRP35968 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDRP35968 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDRP35968 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDRP35968 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDRP35968 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDRP35968 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDRP35968 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
KDRP35968 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms