Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXD13P35453 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms