Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GTF2H1P32780 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2H1P32780 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2H1P32780 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2H1P32780 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2H1P32780 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GTF2H1P32780 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms