Protein–RNA interactions for Protein: P32242

OTX1, Homeobox protein OTX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1P32242 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX1P32242 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX1P32242 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX1P32242 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX1P32242 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX1P32242 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX1P32242 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OTX1P32242 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX1P32242 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX1P32242 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX1P32242 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX1P32242 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX1P32242 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX1P32242 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX1P32242 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX1P32242 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX1P32242 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX1P32242 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX1P32242 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OTX1P32242 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX1P32242 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX1P32242 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX1P32242 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX1P32242 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX1P32242 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX1P32242 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX1P32242 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX1P32242 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX1P32242 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX1P32242 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX1P32242 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX1P32242 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX1P32242 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX1P32242 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX1P32242 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX1P32242 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX1P32242 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX1P32242 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OTX1P32242 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX1P32242 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX1P32242 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX1P32242 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX1P32242 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX1P32242 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX1P32242 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX1P32242 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX1P32242 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX1P32242 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX1P32242 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX1P32242 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX1P32242 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX1P32242 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX1P32242 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX1P32242 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX1P32242 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX1P32242 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OTX1P32242 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTX1P32242 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTX1P32242 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTX1P32242 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTX1P32242 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTX1P32242 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTX1P32242 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTX1P32242 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTX1P32242 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTX1P32242 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTX1P32242 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTX1P32242 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OTX1P32242 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX1P32242 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX1P32242 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX1P32242 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX1P32242 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX1P32242 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX1P32242 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX1P32242 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX1P32242 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX1P32242 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX1P32242 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX1P32242 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX1P32242 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX1P32242 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX1P32242 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX1P32242 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX1P32242 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX1P32242 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OTX1P32242 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTX1P32242 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTX1P32242 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTX1P32242 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTX1P32242 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTX1P32242 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
OTX1P32242 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTX1P32242 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTX1P32242 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTX1P32242 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTX1P32242 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTX1P32242 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OTX1P32242 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
OTX1P32242 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms