Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TM4SF1P30408 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TM4SF1P30408 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 232.1 ms