Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTGFP29279 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CTGFP29279 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTGFP29279 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTGFP29279 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTGFP29279 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTGFP29279 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTGFP29279 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTGFP29279 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTGFP29279 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CTGFP29279 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CTGFP29279 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CTGFP29279 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTGFP29279 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTGFP29279 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTGFP29279 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTGFP29279 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTGFP29279 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTGFP29279 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTGFP29279 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CTGFP29279 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CTGFP29279 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTGFP29279 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CTGFP29279 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTGFP29279 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTGFP29279 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CTGFP29279 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTGFP29279 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTGFP29279 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTGFP29279 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CTGFP29279 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTGFP29279 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CTGFP29279 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CTGFP29279 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTGFP29279 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTGFP29279 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTGFP29279 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTGFP29279 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTGFP29279 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTGFP29279 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTGFP29279 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTGFP29279 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CTGFP29279 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTGFP29279 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTGFP29279 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTGFP29279 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CTGFP29279 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CTGFP29279 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTGFP29279 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CTGFP29279 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CTGFP29279 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTGFP29279 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTGFP29279 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTGFP29279 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTGFP29279 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTGFP29279 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTGFP29279 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CTGFP29279 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTGFP29279 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTGFP29279 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CTGFP29279 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTGFP29279 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTGFP29279 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTGFP29279 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTGFP29279 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTGFP29279 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTGFP29279 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTGFP29279 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CTGFP29279 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTGFP29279 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTGFP29279 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTGFP29279 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTGFP29279 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTGFP29279 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTGFP29279 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTGFP29279 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTGFP29279 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTGFP29279 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTGFP29279 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTGFP29279 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTGFP29279 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTGFP29279 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CTGFP29279 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTGFP29279 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTGFP29279 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTGFP29279 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTGFP29279 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTGFP29279 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTGFP29279 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTGFP29279 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTGFP29279 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTGFP29279 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTGFP29279 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CTGFP29279 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTGFP29279 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTGFP29279 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTGFP29279 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTGFP29279 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTGFP29279 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTGFP29279 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms