Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA2P26232 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNNA2P26232 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNNA2P26232 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNNA2P26232 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNNA2P26232 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNNA2P26232 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNNA2P26232 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNNA2P26232 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNNA2P26232 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA2P26232 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms