Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms