Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTSSP25774 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CTSSP25774 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTSSP25774 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTSSP25774 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTSSP25774 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTSSP25774 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTSSP25774 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTSSP25774 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTSSP25774 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTSSP25774 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTSSP25774 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTSSP25774 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTSSP25774 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTSSP25774 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTSSP25774 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTSSP25774 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTSSP25774 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTSSP25774 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTSSP25774 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTSSP25774 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTSSP25774 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTSSP25774 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTSSP25774 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CTSSP25774 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CTSSP25774 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTSSP25774 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTSSP25774 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTSSP25774 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTSSP25774 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTSSP25774 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTSSP25774 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTSSP25774 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTSSP25774 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTSSP25774 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTSSP25774 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTSSP25774 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CTSSP25774 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTSSP25774 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CTSSP25774 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTSSP25774 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CTSSP25774 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTSSP25774 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTSSP25774 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTSSP25774 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTSSP25774 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTSSP25774 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTSSP25774 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTSSP25774 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTSSP25774 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTSSP25774 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTSSP25774 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTSSP25774 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTSSP25774 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTSSP25774 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTSSP25774 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTSSP25774 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTSSP25774 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTSSP25774 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTSSP25774 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTSSP25774 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTSSP25774 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTSSP25774 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTSSP25774 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTSSP25774 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTSSP25774 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTSSP25774 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTSSP25774 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTSSP25774 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTSSP25774 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CTSSP25774 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTSSP25774 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTSSP25774 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTSSP25774 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTSSP25774 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTSSP25774 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTSSP25774 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTSSP25774 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTSSP25774 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTSSP25774 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTSSP25774 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTSSP25774 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTSSP25774 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CTSSP25774 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTSSP25774 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTSSP25774 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTSSP25774 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTSSP25774 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTSSP25774 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTSSP25774 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTSSP25774 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTSSP25774 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTSSP25774 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CTSSP25774 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CTSSP25774 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CTSSP25774 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTSSP25774 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTSSP25774 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTSSP25774 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTSSP25774 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms