Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTAFRP25105 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTAFRP25105 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms