Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNCP24863 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNCP24863 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNCP24863 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNCP24863 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNCP24863 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNCP24863 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNCP24863 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNCP24863 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNCP24863 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNCP24863 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNCP24863 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNCP24863 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNCP24863 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNCP24863 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNCP24863 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNCP24863 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCNCP24863 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNCP24863 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNCP24863 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNCP24863 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNCP24863 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNCP24863 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNCP24863 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNCP24863 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNCP24863 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNCP24863 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNCP24863 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNCP24863 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNCP24863 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCNCP24863 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNCP24863 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNCP24863 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNCP24863 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNCP24863 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNCP24863 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNCP24863 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNCP24863 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNCP24863 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNCP24863 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNCP24863 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNCP24863 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNCP24863 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCNCP24863 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNCP24863 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNCP24863 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNCP24863 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNCP24863 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNCP24863 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNCP24863 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNCP24863 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNCP24863 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNCP24863 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNCP24863 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNCP24863 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNCP24863 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNCP24863 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNCP24863 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNCP24863 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNCP24863 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNCP24863 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCNCP24863 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNCP24863 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNCP24863 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNCP24863 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNCP24863 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNCP24863 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNCP24863 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNCP24863 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNCP24863 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNCP24863 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNCP24863 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNCP24863 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNCP24863 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNCP24863 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNCP24863 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNCP24863 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNCP24863 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNCP24863 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNCP24863 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNCP24863 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNCP24863 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNCP24863 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNCP24863 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNCP24863 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNCP24863 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNCP24863 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCNCP24863 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNCP24863 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNCP24863 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNCP24863 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNCP24863 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNCP24863 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNCP24863 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNCP24863 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNCP24863 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNCP24863 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNCP24863 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNCP24863 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCNCP24863 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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